建设工程合同如果被确认为无效，工程款的结算应视工程质量是否合格而定。如果工程竣工验收合格，或者验收不合格，但经过修复后合格，那么，施工方可以请求参照施工合同的约定来结算。法律依据是《合同法》第五十八条的规定，合同无效后，因该合同取得的财产应当予以返还，不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。工程施工合同显然不适合返还，而适用折价补偿。

实践中，对“折价补偿”在无效施工合同的适用中有争议。一些法院认为，无效后的结算就是工程量据实计算、计价方式参照合同约定结算；一些法院认为，按定额计算，利润、管理费等不能计算。但，司法解释规定的按照合同约定结算，从文义上来看，就是按照合同约定的计价方式等来结算，涉及利润、管理费等也应计算。

那是不是说合同有效、无效都不影响结算呢?显然不是。如果合同有效，合同当事方均应全面履行约定；如果合同被确认无效，那么只有在工程质量合格的前提下，才可请求参照合同约定结算，结算范围也应限于工程价款，涉及其他违约事项的违约金等则不会获得法院支持。

（本文来源：学法网）